Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms