Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx3P81067 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx3P81067 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx3P81067 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms