Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms