Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BrafP28028 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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