Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprcP06800 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms