Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Atf6bO35451 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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