Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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