Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm6880A3KG45 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm6880A3KG45 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm6880A3KG45 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm6880A3KG45 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm6880A3KG45 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm6880A3KG45 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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