Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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