Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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