Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms