Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms