Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fbxo48Q8CAT8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms