Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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