Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms