Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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