Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms