Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BcanQ61361 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BcanQ61361 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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