Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms