Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx27Q3UHD6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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