Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Apoc2Q05020 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Apoc2Q05020 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Apoc2Q05020 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Apoc2Q05020 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Apoc2Q05020 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Apoc2Q05020 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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