Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms