Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabpb2P81069 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms