Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl39P62892 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms