Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Tmod1P49813 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tmod1P49813 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tmod1P49813 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tmod1P49813 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tmod1P49813 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Tmod1P49813 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Tmod1P49813 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Tmod1P49813 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Tmod1P49813 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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