Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms