Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NudcO35685 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NudcO35685 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NudcO35685 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NudcO35685 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NudcO35685 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NudcO35685 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NudcO35685 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NudcO35685 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms