Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms