Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms