Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms