Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Defb6-201ENSMUST00000063112 323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms