Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms