Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms