Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms