Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Pfdn1Q9CWM4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Pfdn1Q9CWM4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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