Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms