Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Usp20Q8C6M1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Usp20Q8C6M1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Usp20Q8C6M1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp20Q8C6M1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp20Q8C6M1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp20Q8C6M1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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