Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Smchd1Q6P5D8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Smchd1Q6P5D8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Smchd1Q6P5D8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Smchd1Q6P5D8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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