Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms