Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
InipQ3TXT3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
InipQ3TXT3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
InipQ3TXT3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
InipQ3TXT3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
InipQ3TXT3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
InipQ3TXT3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
InipQ3TXT3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
InipQ3TXT3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
InipQ3TXT3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms