Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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