Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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