Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms