Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms