Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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