Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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