Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkchP23298 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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