Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18526 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18526 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18526 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18526 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18526 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18526 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18526 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18526 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18526 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18526 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms