Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CtsdP18242 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CtsdP18242 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms