Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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